Ion Guzun și-a început cariera în funcția de anchetator în cadrul Procuraturii Dubăsari și, ulterior, în cadrul Procuraturii sect. Rîșcani din Chișinău. Judecător devine în 1993, când este numit în funcție la Judecătoria sect. Buiucani, dar după zece ani renunță la mantie și să face avocat. Urmează opt ani de carieră în avocatură, după care îmbracă din nou mantia de judecător, deja la Curtea de Apel Bender, iar peste doar doi ani este avansat la Curtea Supremă de Justiție (CSJ).

Ion Guzun a făcut parte din completul de judecată de la CSJ care, în 2014, l-a eliberat din arest pe interlopul Ion Druță, zis „Vania Pisateli”. Această decizie a fost examinată de Colegiul disciplinar al Consiliul Superior al Magistraturii. În rezultat, judecătorul a fost sancționat disciplinar cu avertisment.

În octombrie 2019, judecătorul a intrat în vizorul Autorității Naționale de Integritate (ANI), după ce jurnaliștii de la Ziarul de Gardă au scris încă în 2016 că magistratul și-a cumpărat un Volvo XC70 cu 255.000 lei și are în construcție o casă. În urma verificărilor, care au durat circa un an și jumătate, ANI a decis încetarea procedurii de control și a considerat inoportună sesizarea organului de urmărire penală.

Magistratul este căsătorit cu judecătoarea Curții de Apel, Maria Guzun, iar fiul magistratului, Denis, este, din 2016, judecător la Judecătoria Chișinău.