С декабря 2014 года по март 2016 года был депутатом от Демократической партии Молдовы. Ранее являлся главой кабинета парламентской фракции ДПМ. По итогам парламентских выборов в феврале 2019 года возвращается в законодательный орган, будучи избранным по национальному списку демократов.

Официально не фигурирует ни в качестве владельца, ни в качестве управляющего каких-либо компаний в Республике Молдова. Живет в роскошном доме площадью более 300 квадратных метров и всегда появляется на публике в сопровождении телохранителей.

До спешного отъезда Владимира Плахотнюка из страны в июне 2019 года, когда демократы потеряли бразды правления, Ботнарь считался его правой рукой, начав свой путь в политику рядом с олигархом в 2012 году.